Agilent Improved 2D nano LC/MS for proteomics applications - A comparison on yeast 此应用说明详细介绍了一种改进的用于蛋白质鉴定的二维纳米液相色谱-质谱（LC/MS）方法，该方法利用强阳离子交换柱上通过增加盐浓度梯度的盐步骤梯度洗脱消化的肽，然后进行反相相分离。然而，在这种方法中，离子交换色谱法并不能发挥其全部性能。为了提高SCX色谱性能，开发了一种新的半连续泵盐梯度的方法。本应用说明介绍了改进的用于二维纳米LC/MS的方法。为了证明该方法的全部性能，分析了酵母蛋白质复杂的胰蛋白酶消化物。采用开发的方法获得的结果与以前使用的注射方法以及离线2D LC方法进行了比较。
Agilent Proteome profiling of E.coli: Effect of heat-shock conditions on protein expression pattern 使用Agilent Nanoflow Proteomics Solution技术在E.coli中鉴定了多种在高温条件下表达的蛋白质，并发现多种热休克蛋白(HSPs)在高温条件下表达水平显著升高。
Agilent Two-dimensional nano-LC/MS for complex proteomics application 这份应用笔记展示了Agilent Nanoflow Proteomics Solution系统作为分析质谱学样品的强大工具。使用阳离子交换、样品富集、反相色谱和纳米喷雾离子阱质谱法，随后进行数据库搜索，从胰蛋白酶消化模型混合物中鉴定出十种蛋白质，并从复杂的E. coli细胞裂解物中鉴定出数百种蛋白质。
Agilent Tools and considerations to increase resolution of complex proteome samples by two-dimensional offline LC/MS 本应用笔记介绍了一种用于提高复杂蛋白质样品的分辨率的离线二维LC / MS方法。该方法采用连续盐梯度在第一个分离维度中进行分离，可在与分步洗脱相比，将复杂样品中鉴定出的蛋白质数量显著提高。此外，该方法还为研究人员提供了很高的灵活性，因为第一维的微分数可存储、重新分析或在进行进一步分析之前进行化学修饰。为了获得最佳分辨率，所采用的二维LC方法强烈需要优化两个分离维度。尤其是洗脱梯度、分析时间、静态相材料和柱尺寸需要合理设计和组装，以实现整体峰容量的显着增加。本应用笔记显示了影响变量和组件的实验数据。它可以作为指导方针，帮助研究人员为特定蛋白质样品调整分离方法，以便通过MS/MS分析获得最大肽序列信息。这将导致在数据库搜索后鉴定出更多的蛋白质。
Agilent Improved protein indentification: Off-line multidimensional LC/MS as an effective tool for proteomics research 通过离线多维LC/MS可以获得高分辨率的质谱信息，提高蛋白质鉴定效果
Agilent Analysis of Organic Acids in Aqueous Samples 本文介绍了一种使用离子抑制液相色谱（ISC）分离有机酸的方法，该方法使用反相液相色谱柱和二极管阵列检测器。实验中，使用了一种新型的ZORBAX SB Aq柱，该柱可成功地分离有机酸。两种标准混合有机酸和许多软饮料和葡萄酒都进行了分析。
Agilent Accurate Mass Measurement for Intact Proteins using ESI-oa-TOF 本文介绍了质谱技术在蛋白质研究中的应用，重点探讨了电喷雾离子化结合飞行时间质谱仪在蛋白质鉴定中的优势和挑战。
Agilent Protein Confirmation Using the LC/MSD TOF and the Agilent TOF Protein Confirmation Software 1
Agilent Therapeutic Drug Monitoring by LC/MSD - Clozapine, an Example 该论文介绍了LC/MS在药物监测中的应用，通过该技术可以对200多种药物进行分析，包括鉴定和定量。
Agilent Mass-based fraction collection of compound libraries using the Agilent 1100 Series purification system 使用Agilent 1100系列纯化系统对化合物库进行质量分辨率分馏
Agilent Optimizing the Agilent 1100 Series high throughput LC/MS system 本文介绍了如何优化Agilent 1100系列高通量LC/MS系统，以适应不同的分析任务。详细描述了如何在保持样品通量的同时，优化色谱、二极管阵列和MSD检测，实现物质鉴定；如何在保持非常高的样品通量的同时获得定量信息；以及如何快速分析非常少量的样品。
Agilent Technologies Determination of Alkylphenols and Alkylphenol Mono- and Diethoxylates in Sewage Sludge by High Speed Gas Chromatography/Mass Spectrometry 该文件描述了一种用于污泥样品中4-壬基酚（NP）、4-壬基酚单乙氧基酸酯（NP1EO）和4-壬基酚二乙氧基酸酯（NP2EO）的定量测定的常规方法。使用Soxtec®提取程序从固体基质中富集目标化合物。采用短极性熔融硅胶柱进行高速气相色谱/质谱定量测定。衍生化使得可以通过气相色谱分析NP1EO和NP2EO。对于分析的10个不同污泥，每个样品分析7次，相对标准偏差接近5%。通过对污泥参考材料进行回收率测定，回收率高于90%。实验定量限为2、5和5μg/g干物质（μg/g DM），分别适用于NP、NP1EO和NP2EO的测定。该方法的结果与我们先前使用氨基硅胶柱的正相液相色谱方法得到的结果一致。该方法应用于污水污泥中烷基酚和烷基酚单酯和二酯的高速气相色谱/质谱测定应用。
Agilent Technologies The Analysis of Perchlorate by Ion Chromatography/Mass Spectrometry 该文件介绍了一种使用离子色谱-质谱(IC/MS)方法测定亚ppb级过氯酸盐的方法。该方法遵循EPA Method 314方法，该方法最初是为在单个ppb范围内使用电导率检测的IC开发的[1]。该IC/MS方法不受Method 314中描述的干扰矩阵对过氯酸盐回收率的影响。在合成饮用水和废水中，在0.5和1 ppb水平上的典型回收率为90%-105%，方法检测限(MDL)低于100 ppt。
Agilent Technologies Determination of Ultratrace Amitrol in Water Samples by in situ Derivatization-Solid Phase Extraction-Liquid Chromatography-Mass Selective Detector 1
