Agilent Rapid Protein Characterization using Microflow LC/MS/MS Techniques

该文档介绍了使用微流体LC/MS/MS技术进行快速蛋白质表征的方法。该方法通过在线微毛细管液相色谱法结合自动串联质谱技术，对蛋白质进行消化并分离出肽段。通过自动的数据依赖扫描功能，每个肽段在洗脱时自动选择进行碰撞诱导解离。然后，利用计算机算法将未解释的蛋白质和肽段串联质谱数据与蛋白质或核苷酸数据库中的序列进行相关性分析，实现蛋白质的鉴定。该方法不仅具有自动化高通量数据分析的潜力，还能通过串联质谱谱图显示每个氨基酸序列的独特指纹模式，从而增加数据库搜索的特异性。